1、免疫反应太弱

机体对疫苗的免疫反应太弱，只产生微量抗体，以至用先进的检测方法仍未能发现表面抗体的踪迹。这时可加大乙肝疫苗的剂量(每次10ug)，每月注射1次，共3次。注射乙肝疫苗的同时合用其他免疫刺激药物，如猪苓多糖、胸腺肽、卡介苗等，可以提高免疫效果。

2、免疫功能低下

水痘、伤寒等患者、免疫缺陷者、有晚期肾病、器官移植、艾滋病感染等类似情况的人不易产生抗体。正使用免疫抑制药物的病人接种乙肝疫苗也不易产生乙肝抗体，个别儿童免疫功能发育尚不健全，少数人在儿童期注射乙肝疫苗可能不产生抗体，或产生的抗体过少，无保护作用。

3、乙肝病毒容易发生变异

变异后的病毒，生物特性有了新的变化，可使乙肝疫苗无法发挥作用。另外，一些乙肝病毒感染者，乙肝病毒表面抗原的亚型有所不同。乙肝疫苗是针对主要的病毒亚型而漫，所以难免有顾及不到的亚型，如果是较为罕见的病毒亚型，乙肝疫苗也不会有保护作用。

4、乙肝疫苗效价过低

现在的乙肝疫苗就是通过基因工程制造的纯度很高的重组乙肝表面抗原(HBsAg)，是一种蛋白质，同其他蛋白质娄药物一样，必须保存在2℃-8℃范围内才最稳定。如果在存储、运输和使用过程中所处温度过低或过高，使疫苗冻结或凝结，其免疫效果就可能降低或丧失。所以乙肝疫苗最好在医院或防疫站直接接种，不要取出带回家或在另外地方注射。

5、身体已产生免疫耐受

部分人可能在儿童期感染少量乙肝病毒，后来病毒虽被机体非特异免疫清除，但身体已对乙肝病毒产生免疫耐受，接种疫苗无法产生抗体。

6、慢性隐匿性乙肝病毒携带者

还有一种情况是，目前已缝感染乙肝病毒，正处于窗口期或者已经成为慢性隐匿性乙肝病毒携带者。处于窗口期的人群茌以后的半年至2年期司乙肝抗体会出现，而隐匿性乙肝携带者则可能逐渐出现表面抗原阳性而成为慢性乙型肝炎。

7、与接种年龄有关

年龄对乙肝疫苗的应答率高低有明显关系，新生儿应答率较高，60岁以上血清阳转不到50%。

8、与接种部位有关。

9、与吸烟、肾透析有关

据认为吸烟对免疫功能有损害，尼古丁引起慢性周围血管收缩，延迟了疫苗的吸收。